Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ALKQ9UM73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ALKQ9UM73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms