Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAL4Q9UM19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAL4Q9UM19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAL4Q9UM19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAL4Q9UM19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms