Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZNRF3Q9ULT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNRF3Q9ULT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms