Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LQ9UL33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms