Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL4Q9UJQ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL4Q9UJQ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL4Q9UJQ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms