Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJM3

ERRFI1, ERBB receptor feedback inhibitor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERRFI1Q9UJM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERRFI1Q9UJM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERRFI1Q9UJM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERRFI1Q9UJM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms