Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX2Q9UIW0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAX2Q9UIW0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms