Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUFIP1Q9UHK0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUFIP1Q9UHK0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms