Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4Q9UBN4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRPC4Q9UBN4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms