Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPRR3Q9UBC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRR3Q9UBC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms