Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MBD5Q9P267 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
MBD5Q9P267 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MBD5Q9P267 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms