Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNRD1Q9P1U0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNRD1Q9P1U0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms