Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4Q9P0V3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4Q9P0V3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms