Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA13Q9P0J0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA13Q9P0J0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA13Q9P0J0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA13Q9P0J0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NDUFA13Q9P0J0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFA13Q9P0J0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms