Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH4Q9P003 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms