Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP5Q9NZZ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP5Q9NZZ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP5Q9NZZ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP5Q9NZZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms