Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MSRB1Q9NZV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MSRB1Q9NZV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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