Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USE1Q9NZ43 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USE1Q9NZ43 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USE1Q9NZ43 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USE1Q9NZ43 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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