Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VNN3Q9NY84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms