Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX43Q9NXZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX43Q9NXZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX43Q9NXZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX43Q9NXZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms