Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL28Q9NXS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL28Q9NXS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms