Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIN1Q9NXP7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIN1Q9NXP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIN1Q9NXP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms