Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms