Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM28Q9NW13 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM28Q9NW13 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM28Q9NW13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms