Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
INTS9Q9NV88 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
INTS9Q9NV88 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms