Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMC4Q9NTJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC4Q9NTJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC4Q9NTJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms