Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERINC1Q9NRX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms