Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS45Q9NRW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS45Q9NRW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms