Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM1Q9NRU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM1Q9NRU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CNNM1Q9NRU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM1Q9NRU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms