Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3GLB2Q9NR46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GLB2Q9NR46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GLB2Q9NR46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 558.8 ms