Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM8Q9NQV8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM8Q9NQV8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms