Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLDQ9NQC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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