Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASCL3Q9NQ33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms