Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms