Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1RAPQ9NPH3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IL1RAPQ9NPH3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL1RAPQ9NPH3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms