Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TUFT1Q9NNX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TUFT1Q9NNX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms