Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KIAA1549Q9HCM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KIAA1549Q9HCM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA1549Q9HCM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms