Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC24A3Q9HC58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC24A3Q9HC58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms