Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM27Q9HBJ8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM27Q9HBJ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms