Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDFQ9HBH1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDFQ9HBH1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDFQ9HBH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms