Protein–RNA interactions for Protein: Q9H871

RMND5A, Protein RMD5 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMND5AQ9H871 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMND5AQ9H871 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMND5AQ9H871 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMND5AQ9H871 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms