Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNDIG1Q9H7V2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms