Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNCQ9H7C4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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