Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIF1Q9H611 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIF1Q9H611 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms