Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD1Q9H4M9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms