Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRABDQ9H4I3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRABDQ9H4I3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms