Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF3Q9H4D5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms