Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP4Q9H3Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP4Q9H3Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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