Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIOBPQ9H2D6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOBPQ9H2D6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOBPQ9H2D6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms