Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG5Q9H1Y0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG5Q9H1Y0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms